В музее истории медицины собран богатый документальный материал. Кроме того, в нем представлены медицинские инструменты, книги, элементы интерьера аптеки и кабинета врача конца XIX- начала XX века. В фондах музея – архивы фотографий и документов, медицинские инструменты, подаренные музею врачами.

Экспозиции музея постоянно обновляются. Музей проводит научную работу, восстанавливая историю развития здравоохранения в Астраханском крае. Одна из последних выставок музея посвящена истории Александро-Мариинской больницы.